MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	TA	3	6	399	404	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
2	NC_021515	AT	3	6	433	438	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
3	NC_021515	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
4	NC_021515	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
5	NC_021515	TGC	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842866
6	NC_021515	ACA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842866
7	NC_021515	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
8	NC_021515	T	8	8	682	689	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
9	NC_021515	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
10	NC_021515	TTC	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
11	NC_021515	T	8	8	813	820	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
12	NC_021515	AT	3	6	822	827	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
13	NC_021515	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
14	NC_021515	AAG	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
15	NC_021515	TCA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
16	NC_021515	AGG	2	6	906	911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513842866
17	NC_021515	ACC	2	6	924	929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842866
18	NC_021515	AGA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
19	NC_021515	CTT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
20	NC_021515	TA	3	6	995	1000	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
21	NC_021515	TTTAAA	2	12	1018	1029	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
22	NC_021515	TTA	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
23	NC_021515	TAT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
24	NC_021515	T	6	6	1084	1089	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
25	NC_021515	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
26	NC_021515	T	6	6	1160	1165	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
27	NC_021515	ATTA	2	8	1182	1189	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
28	NC_021515	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
29	NC_021515	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
30	NC_021515	CAAC	2	8	1316	1323	50 %	0 %	0 %	50 %	513842866
31	NC_021515	GA	3	6	1337	1342	50 %	0 %	50 %	0 %	513842866
32	NC_021515	ATCT	2	8	1343	1350	25 %	50 %	0 %	25 %	513842866
33	NC_021515	A	7	7	1365	1371	100 %	0 %	0 %	0 %	513842866
34	NC_021515	T	6	6	1471	1476	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
35	NC_021515	T	6	6	1550	1555	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
36	NC_021515	TAA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
37	NC_021515	AT	3	6	1615	1620	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
38	NC_021515	TCTTT	2	10	1699	1708	0 %	80 %	0 %	20 %	513842866
39	NC_021515	T	8	8	1768	1775	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
40	NC_021515	ATTT	2	8	1781	1788	25 %	75 %	0 %	0 %	513842866
41	NC_021515	GGCT	2	8	1813	1820	0 %	25 %	50 %	25 %	513842866
42	NC_021515	AAAG	2	8	1822	1829	75 %	0 %	25 %	0 %	513842866
43	NC_021515	ATAA	2	8	1875	1882	75 %	25 %	0 %	0 %	513842866
44	NC_021515	AAG	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
45	NC_021515	CTT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
46	NC_021515	T	7	7	2983	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	513842867
47	NC_021515	GC	3	6	3066	3071	0 %	0 %	50 %	50 %	513842867
48	NC_021515	CTGTT	2	10	3080	3089	0 %	60 %	20 %	20 %	513842867
49	NC_021515	TCTT	2	8	3165	3172	0 %	75 %	0 %	25 %	513842867
50	NC_021515	TTTC	2	8	3230	3237	0 %	75 %	0 %	25 %	513842867
51	NC_021515	TTC	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
52	NC_021515	TATC	2	8	3294	3301	25 %	50 %	0 %	25 %	513842867
53	NC_021515	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	513842867
54	NC_021515	A	7	7	3350	3356	100 %	0 %	0 %	0 %	513842867
55	NC_021515	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
56	NC_021515	A	6	6	3369	3374	100 %	0 %	0 %	0 %	513842867
57	NC_021515	GTT	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
58	NC_021515	ATT	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
59	NC_021515	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842867
60	NC_021515	TA	3	6	3508	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	513842867
61	NC_021515	TA	3	6	3524	3529	50 %	50 %	0 %	0 %	513842867
62	NC_021515	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842867
63	NC_021515	AACA	2	8	3572	3579	75 %	0 %	0 %	25 %	513842867
64	NC_021515	TAC	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
65	NC_021515	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
66	NC_021515	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
67	NC_021515	GTT	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
68	NC_021515	A	7	7	3766	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	513842867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.